SHD Research ID: shd0007.v1

研究内容の概要

目的： 健康な日本人における食事や生活習慣と遺伝的背景との関連性の解明を目指したデータ集積

方法： 末梢血由来のDNAを用いたSNPアレイ解析

対象： shd0004（京都大学において実施した「すこやか健康調査」）の健常人49名

データID	内容	制限	公開日
shd0007	健常人49名のgenotypingデータ	制限共有	2023/02/21

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分子データ


対象	健常成人：49名
規模	genome wide SNPs
対象領域（Target Captureの場合）	-
Platform	Affymetrix [Japonica Array v2]
ソース	末梢血から抽出したDNA
検体情報（購入の場合）	-
調整試薬（キット名、バージョン）	Axiom 2.0 Reagent Kit
遺伝子型決定アルゴリズム（ソフトウェア）	Axiom Analysis suite v4.0.0.28
フィルタリング	サンプルQC: Dish QC ≥0.82 & QC call rate ≥97%
マーカー数（QC後）	659,709 SNPs
SIP Healthcare Group Sharing Database Dataset ID	shd0007
総データ量	160 MB（ped＋map）
コメント（利用にあたっての制限事項）	SHD policy

研究代表者： 稲垣暢也

所属機関： 京都大学大学院医学研究科　糖尿病・内分泌・栄養内科学

URL： https://e-healthsurvey.jp/

プロジェクト/研究グループ名： 「戦略的イノベーション創造プログラム（SIP）［スマートバイオ産業・農業基盤技術］」における「食を通じた健康システムの確立による健康寿命の延伸への貢献」プロジェクト

科研費/助成金（Research Project Number）：

科研費・助成金名	タイトル	研究課題番号
SIP スマートバイオ産業・農業基盤技術	食を通じた健康システムの確立による健康寿命の延伸への貢献