SHD Dataset ID: shd0001.v4
研究内容の概要
目的：健康な日本人における腸内細菌叢と、食事や生活習慣との関連性の解明を目指したデータ集積
方法：すこやか健康調査の第I期（2019年6月～2020年3月）および第II期（2020年5月～2021年3月）の夏と冬に実施した、血液検査・尿検査・体組成測定・質問票・医師の問診結果・睡眠日誌・睡眠時心拍と脳波測定・微生物組成・食事調査、食事摂取頻度調査、メタボロミクス（一部項目は夏または冬のみ実施）
対象：ご本人の自由意思により研究参加に同意いただいた健常成人（20歳以上80歳未満）
URL：https://e-healthsurvey.jp/
制限事項：SHD policy
| データセットID | 内容 | 制限 | 公開日 |
|---|---|---|---|
| shd0001.v1 |
2019年夏の642名分のデータ |
制限共有 | 2021/10/19 |
| shd0001.v2 |
shd0001.v1に加え、2019年冬の642名分のデータ （shd0001.v1はshd0001.v2に統合されました） その他追加されたデータ（2019年夏・冬） その他追加されたデータ（2019年冬のみ） |
制限共有 | 2021/12/24 |
| shd0001.v3 |
2019年夏の642名分のデータ 【質問票】に含まれる抗菌薬使用の有無と糞便の性状について整理したcsvファイルの追加 |
制限共有 | 2022/3/17 |
| shd0001.v4 |
2020年夏・冬の321名分のデータ |
制限共有 | 2023/02/21 |
※リリース情報はこちら
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| データ項目一覧 | すこやか健康調査_データ項目一覧.xlsx |
| 対象 |
健常成人：642名（2019年夏・冬） 健常成人：321名（2020年夏・冬） |
| 調査項目 | 測定年、年齢、性別、地域、調査の途中での中止の有無 |
| ファイル名 |
summer/winter：research.txt（39 KB / 37 KB） 2020_summer/winter：research.txt（20 KB / 19 KB） |
| 対象 |
健常成人：642名（2019年夏・冬） 健常成人：321名（2020年夏）、307名（2020年冬） |
| 検査項目 |
【一般】白血球（×103/μl）、赤血球（×104/μl）、ヘモグロビン（g/dl）、ヘマトクリット（％）、血小板（×104/μl） 【肝機能】GOT（IU/l）、GPT（IU/l）、γ-GTP（IU/l）、ALP（IU/l）、LDH(IU/l) 【腎機能】BUN（mg/dl）、クレアチニン（mg/dl）、尿酸（mg/dl） 【脂質】総コレステロール（mg/dl）、中性脂肪（mg/dl）、HDLコレステロール（mg/dl）、LDLコレステロール（mg/dl） 【血糖】血糖（mg/dl）、HbA1c（％：NGSP値） 【内分泌】甲状腺刺激ホルモン（μIU/ml） 【栄養状態】総タンパク（g/dl）、アルブミン（g/dl）、コリンエステラーゼ（U/l）、ナトリウム（mEq/l）、クロール（mEq/l）、マグネシウム（mg/dl）、カルシウム（mg/dl）、鉄（μg/dl） |
| ファイル名 |
summer/winter：blood_test.txt（126 KB / 116 KB） 2020_summer/winter：blood_test.txt（69 KB / 65 KB） |
| 対象 |
健常成人：642名（2019年夏・冬） 健常成人：321名（2020年夏）、307名（2020年冬） |
| 検査項目 | 尿糖、尿たんぱく、ウロビリノーゲン、尿ビリルビン、尿中ケトン体、尿pH、尿潜血、セロトニン代謝産物（5-HIAA：mg/l） |
| ファイル名 |
summer/winter：urinalysis.txt（49 KB / 47 KB） 2020_summer/winter：urinalysis.txt（25 KB / 24 KB） |
| 対象 |
健常成人：642名（2019年夏・冬） 健常成人：321名（2020年夏）、307名（2020年冬） |
| 検査項目 | 血圧（収縮期、拡張期：mmHg）、脈拍（回/分）、身長（cm）、腹囲（cm）、体重（kg）、BMI（kg/m2）、体脂肪率（％） |
| ファイル名 |
summer/winter：physical_vital.txt（60 KB / 56 KB） 2020_summer/winter：physical_vital.txt（30 KB / 28 KB） |
| 対象 |
健常成人：642名（2019年夏・冬） 健常成人：321名（2020年夏）、307名（2020年冬） |
| 調査項目 |
夏：教育歴、職業・職種、家族構成、既往歴、治療中の疾患、ストレス状態・睡眠状態に関する質問票、など 抗菌薬の使用状況と糞便の性状について整理したファイルを追加 冬：治療中の疾患、ストレス状態・睡眠状態に関する質問票、など |
| ファイル名 |
summer/winter：questionnaire.txt（796 KB / 581 KB） 2019_summer：questionaire_antibiotics_2019.csv（72 KB） 2020_summer/winter：questionnaire.txt（420 KB / 310 KB） questionaire_antibiotic_2020.csv（29 KB） |
| 説明ファイル | 抗菌薬使用の有無について.txt |
| 対象 |
健常成人：642名（2019年夏・冬） 健常成人：321名（2020年夏）、307名（2020年冬） |
| 調査項目 | 検査前の食事時間、献血の有無、妊娠・授乳の有無 |
| ファイル名 |
summer/winter：interview.txt（42 KB / 38 KB） 2020_summer/winter：interview.txt（20 KB / 19 KB） |
| 対象 |
健常成人：642名（2019年夏・冬） 健常成人：321名（2020年夏）、306名（2020年冬） |
| 調査項目 | 寝る前の体調、夜間の目覚め、起きた時の体調などに関するアンケート |
| ファイル名 |
summer/winter：diary_calc.txt（805 KB / 805 KB） 2020_summer/winter：diary_calc.txt（450 KB / 428 KB） |
| 対象 |
健常成人：625名（2019年夏）、575名（2019年冬） 健常成人：319名（2020年夏）、308名（2020年冬） |
| 調査項目 | 睡眠時の心拍と脳波の測定データ（睡眠時間、覚醒回数、心拍の平均値等、90項目） |
| ファイル名 |
SIP2B観察研究（心拍と脳波）_2019/SIP2B観察研究（心拍と脳波）_2019_summer/winter.csv（613 KB / 551 KB） 2020_すこやか心拍脳波/SIP2B観察研究（心拍と脳波）_2020_summer/winter.csv（317 KB / 300 KB） |
| 説明ファイル | 心拍脳波データ項目.xlsx |
| 内容 | 対象 | ファイル名 |
|---|---|---|
|
糞便のショートリードショットガンメタゲノム解析の KEGG Orthologyによる遺伝子機能組成データ |
641名（2019年夏） 158名（2019年冬） 309名（2020年夏・冬） |
summary_kegg_brite_abundance_2019_summer.txt（2,300,000 KB） summary_kegg_brite_abundance_2019_winter.txt（802,000 KB） metagenomics/summary_functional_ko_abundances_Hokkaido.tsv（17,400 KB） |
|
糞便のショートリードショットガンメタゲノム解析の Kraken2による微生物の組成データ【種】 |
641名（2019年夏） 158名（2019年冬） 309名（2020年夏・冬） |
summary_kraken2_1_species_2019_summer.txt（32,700 KB） summary_kraken2_1_species_2019_winter.txt（8,500 KB） metataxonomics/summary_taxonomic_species_abundances_Hokkaido.tsv（8,800 KB） |
|
糞便のショートリードショットガンメタゲノム解析の Kraken2による微生物の組成データ【属】 |
641名（2019年夏） 158名（2019年冬） 309名（2020年夏・冬） |
summary_kraken2_2_genus_2019_summer.txt（10,500 KB） summary_kraken2_2_genus_2019_winter.txt（2,600 KB） metataxonomics/summary_taxonomic_genus_abundances_Hokkaido.tsv（2,200 KB） |
|
糞便のショートリードショットガンメタゲノム解析の Kraken2による微生物の組成データ【科】 |
641名（2019年夏） 158名（2019年冬） 309名（2020年夏・冬） |
summary_kraken2_3_family_2019_summer.txt（4,100 KB） summary_kraken2_3_family_2019_winter.txt（1,100 KB） metataxonomics/summary_taxonomic_family_abundances_Hokkaido.tsv（470 KB） |
|
糞便のショートリードショットガンメタゲノム解析の Kraken2による微生物の組成データ【目】 |
641名（2019年夏） 158名（2019年冬） |
summary_kraken2_4_order_2019_summer.txt（1,800 KB） summary_kraken2_4_order_2019_winter.txt（464 KB） |
|
糞便のショートリードショットガンメタゲノム解析の Kraken2による微生物の組成データ【綱】 |
641名（2019年夏） 158名（2019年冬） |
summary_kraken2_5_class_2019_summer.txt（725 KB） summary_kraken2_5_class_2019_winter.txt（185 KB） |
|
糞便のショートリードショットガンメタゲノム解析の Kraken2による微生物の組成データ【門】 |
641名（2019年夏） 158名（2019年冬） 309名（2020年夏・冬） |
summary_kraken2_6_phylum_2019_summer.txt（342 KB） summary_kraken2_6_phylum_2019_winter.txt（87 KB） metataxonomics/summary_taxonomic_phylum_abundances_Hokkaido.tsv（69 KB） |
| 説明ファイル | - | メタゲノムデータの説明.txt |
| 対象 |
健常成人：625名（2019年夏）、579名（2019年冬） 健常成人：316名（2020年夏）、303名（2020年冬） |
| 調査項目 | 総たんぱく質やナトリウムなど57種類の栄養素摂取量、および、米や豆腐など148種類の食品群別摂取量のデータ |
| ファイル名 |
栄養素摂取量_食品群別摂取量/SIP2019夏_栄養素摂取量_食品群別摂取量.txt（545 KB） 栄養素摂取量_食品群別摂取量/SIP2019冬_栄養素摂取量_食品群別摂取量.txt（507 KB） 栄養素摂取量_食品群別摂取量/SIP2020夏_北海道_東京_栄養素摂取量・食品群別摂取量_271名+45.txt（282 KB） 栄養素摂取量_食品群別摂取量/SIP2020冬_北海道_東京_栄養素摂取量・食品群別摂取量_260名+43.txt（266 KB） |
| 説明ファイル |
栄養計算結果データにつきまして.pdf 食事調査栄養素摂取量・食品群別摂取量ラベル.xlsx |
| 対象 |
健常成人：609名（2019年冬のみ） 健常成人：307名（2020年冬のみ） |
| 調査項目 | 牛肉やたこ等、様々な食品705項目の摂取頻度 |
| ファイル名 |
2019_winter/ffq_all.txt（2,900 KB） 2020_winter/ffq_all.txt（1,500 KB） |
| 説明ファイル | FFQ出力項目と単位（Ver.5版）.xlsx |
| 内容 | 対象 | ファイル名 |
|---|---|---|
| 血漿中親水性代謝産物のターゲットメタボローム解析データ |
160名（2019年冬） 43名（2020年夏） |
floraindex_blood_2019_winter.txt（359 KB） metabolomics/summary_targeted_blood_datasets2020_Hokkaido.tsv（248 KB） |
| 糞便中親水性代謝産物のターゲットメタボローム解析データ |
158名（2019年冬） 43名（2020年夏） |
floraindex_feces_2019_winter.txt（274 KB） metabolomics/summary_targeted_feces_datasets2020_Hokkaido.tsv（207 KB） |
| 糞便中親水性代謝産物のノンターゲットメタボローム解析データ |
158名（2019年冬） 43名（2020年夏） |
floraindex_feces_nontarget_2019_winter.txt（1,500 KB） metabolomics/summary_untargeted_dataset2020_Hokkaido.tsv（2,900 KB） |
| 糞便中胆汁酸のターゲットメタボローム解析データ |
158名（2019年冬） 43名（2020年夏） |
kazusa_feces_2019_winter.txt（27 KB） metabolomics/summary_bileacids_dataset2020_Hokkaido.tsv（8 KB） |
| 糞便中脂質のノンターゲットメタボローム解析データ |
158名（2019年冬） 43名（2020年夏） |
kazusa_feces_nontarget_2019_winter.tsv（382 KB） metabolomics/summary_lipids_dataset2020_Hokkaido.tsv（128 KB） |
| 血漿中タンパク質のノンターゲット解析データ |
160名（2019年冬） 43名（2020年夏） |
olink_blood_2019_winter.tsv（241 KB） metabolomics/summary_olink_datasets2020_Hokkaido.tsv（67 KB） |
| 説明ファイル | - | メタボロームデータの説明.txt |
提供者情報
研究代表者： 西平 順
所 属 機 関： 北海道情報大学 医療情報学部 医療情報学科
URL： https://e-healthsurvey.jp/
プロジェクト/研究グループ名： 「戦略的イノベーション創造プログラム（SIP）［スマートバイオ産業・農業基盤技術］」における「食を通じた健康システムの確立による健康寿命の延伸への貢献」プロジェクト
科研費/助成金（Research Project Number）：
| 科研費・助成金名 | タイトル | 研究課題番号 |
|---|---|---|
| SIP スマートバイオ産業・農業基盤技術 | 食を通じた健康システムの確立による健康寿命の延伸への貢献 |
関連論文
| タイトル | DOI | データID | |
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