SHD Dataset ID: shd0001.v2
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研究内容の概要
目的:健康な日本人における腸内細菌叢と、食事や生活習慣との関連性の解明を目指したデータ集積
方法:すこやか健康調査の第I期(2019年6月~2020年3月)の夏と冬に実施した、血液検査・尿検査・体組成測定・質問票・医師の問診結果・睡眠日誌・睡眠時心拍と脳波測定・微生物組成・食事調査、ならびに、冬に実施した食事摂取頻度調査・メタボロミクス
対象:ご本人の自由意思により研究参加に同意いただいた健常成人(20歳以上80歳未満)
URL:https://e-healthsurvey.jp/
制限事項:SHD policy
データセットID | 内容 | 制限 | 公開日 |
---|---|---|---|
shd0001.v1 |
2019年夏の642名分のデータ |
制限共有 | 2021/10/19 |
shd0001.v2 |
shd0001.v1に加え、2019年冬の642名分のデータ (shd0001.v1はshd0001.v2に統合されました) その他追加されたデータ(2019年夏・冬) その他追加されたデータ(2019年冬のみ) |
制限共有 | 2021/12/24 |
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分子データ
データ項目一覧 | すこやか健康調査_データ項目一覧.xlsx |
対象 | 健常成人:642名(2019年夏・冬) |
調査項目 | 測定年、年齢、性別、地域、調査の途中での中止の有無 |
ファイル名 | summer/winter:research.txt(39 KB / 37 KB) |
対象 | 健常成人:642名(2019年夏・冬) |
検査項目 |
【一般】白血球(×103/μl)、赤血球(×104/μl)、ヘモグロビン(g/dl)、ヘマトクリット(%)、血小板(×104/μl) 【肝機能】GOT(IU/l)、GPT(IU/l)、γ-GTP(IU/l)、ALP(IU/l)、LDH(IU/l) 【腎機能】BUN(mg/dl)、クレアチニン(mg/dl)、尿酸(mg/dl) 【脂質】総コレステロール(mg/dl)、中性脂肪(mg/dl)、HDLコレステロール(mg/dl)、LDLコレステロール(mg/dl) 【血糖】血糖(mg/dl)、HbA1c(%:NGSP値) 【内分泌】甲状腺刺激ホルモン(μIU/ml) 【栄養状態】総タンパク(g/dl)、アルブミン(g/dl)、コリンエステラーゼ(U/l)、ナトリウム(mEq/l)、クロール(mEq/l)、マグネシウム(mg/dl)、カルシウム(mg/dl)、鉄(μg/dl) |
ファイル名 | summer/winter:blood_test.txt(126 KB/ 116 KB) |
対象 | 健常成人:642名(2019年夏・冬) |
検査項目 | 尿糖、尿たんぱく、ウロビリノーゲン、尿ビリルビン、尿中ケトン体、尿pH、尿潜血、セロトニン代謝産物(5-HIAA:mg/l) |
ファイル名 | summer/winter:urinalysis.txt(49 KB / 47 KB) |
対象 | 健常成人:642名(2019年夏・冬) |
検査項目 | 血圧(収縮期、拡張期:mmHg)、脈拍(回/分)、身長(cm)、腹囲(cm)、体重(kg)、BMI(kg/m2)、体脂肪率(%) |
ファイル名 | summer/winter:physical_vital.txt(60 KB / 56 KB) |
対象 | 健常成人:642名(2019年夏・冬) |
調査項目 |
夏:教育歴、職業・職種、家族構成、既往歴、治療中の疾患、ストレス状態・睡眠状態に関する質問票、など 冬:治療中の疾患、ストレス状態・睡眠状態に関する質問票、など |
ファイル名 | summer/winter:questionnaire.txt(796 KB / 581 KB) |
対象 | 健常成人:642名(2019年夏・冬) |
調査項目 | 検査前の食事時間、献血の有無、妊娠・授乳の有無 |
ファイル名 | summer/winter:interview.txt(42 KB/ 38 KB) |
対象 | 健常成人:642名(2019年夏・冬) |
調査項目 | 寝る前の体調、夜間の目覚め、起きた時の体調などに関するアンケート |
ファイル名 | summer/winter:diary_calc.txt(805 KB / 805 KB) |
対象 | 健常成人:625名(2019年夏)、575名(2019年冬) |
調査項目 | 睡眠時の心拍と脳波の測定データ(睡眠時間、覚醒回数、心拍の平均値等、90項目) |
ファイル名 |
SIP2B観察研究(心拍と脳波)_2019/SIP2B観察研究(心拍と脳波)_2019_Summer.csv(613 KB) SIP2B観察研究(心拍と脳波)_2019/SIP2B観察研究(心拍と脳波)_2019_Winter.csv(551 KB) |
説明ファイル | 心拍脳波データ項目.xlsx |
内容 | 対象 | ファイル名 |
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糞便のショートリードショットガンメタゲノム解析の KEGG Orthologyによる遺伝子機能組成データ |
641名(2019年夏) 158名(2019年冬) |
summary_kegg_brite_abundance_2019_summer.txt(2,300,000 KB) summary_kegg_brite_abundance_2019_winter.txt(802,000 KB) |
糞便のショートリードショットガンメタゲノム解析の Kraken2による微生物の組成データ【種】 |
641名(2019年夏) 158名(2019年冬) |
summary_kraken2_1_species_2019_summer.txt(32,700 KB) summary_kraken2_1_species_2019_winter.txt(8,500 KB) |
糞便のショートリードショットガンメタゲノム解析の Kraken2による微生物の組成データ【属】 |
641名(2019年夏) 158名(2019年冬) |
summary_kraken2_2_genus_2019_summer.txt(10,500 KB) summary_kraken2_2_genus_2019_winter.txt(2,600 KB) |
糞便のショートリードショットガンメタゲノム解析の Kraken2による微生物の組成データ【科】 |
641名(2019年夏) 158名(2019年冬) |
summary_kraken2_3_family_2019_summer.txt(4,100 KB) summary_kraken2_3_family_2019_winter.txt(1,100 KB) |
糞便のショートリードショットガンメタゲノム解析の Kraken2による微生物の組成データ【目】 |
641名(2019年夏) 158名(2019年冬) |
summary_kraken2_4_order_2019_summer.txt(1,800 KB) summary_kraken2_4_order_2019_winter.txt(464 KB) |
糞便のショートリードショットガンメタゲノム解析の Kraken2による微生物の組成データ【綱】 |
641名(2019年夏) 158名(2019年冬) |
summary_kraken2_5_class_2019_summer.txt(725 KB) summary_kraken2_5_class_2019_winter.txt(185 KB) |
糞便のショートリードショットガンメタゲノム解析の Kraken2による微生物の組成データ【門】 |
641名(2019年夏) 158名(2019年冬) |
summary_kraken2_6_phylum_2019_summer.txt(342 KB) summary_kraken2_6_phylum_2019_winter.txt(87 KB) |
説明ファイル | - | メタゲノムデータの説明.txt |
対象 | 健常成人:625名(2019年夏)、579名(2019年冬) |
調査項目 | 総たんぱく質やナトリウムなど57種類の栄養素摂取量、および、米や豆腐など148種類の食品群別摂取量のデータ |
ファイル名 |
栄養素摂取量_食品群別摂取量/SIP2019夏_栄養素摂取量_食品群別摂取量.txt(545 KB) 栄養素摂取量_食品群別摂取量/SIP2019冬_栄養素摂取量_食品群別摂取量.txt(507 KB) |
説明ファイル |
栄養計算結果データにつきまして.pdf 食事調査栄養素摂取量・食品群別摂取量ラベル.xlsx |
対象 | 健常成人:609名(2019年冬のみ) |
調査項目 | 牛肉やたこ等、様々な食品705項目の摂取頻度 |
ファイル名 | 2019_winter/ffq_all.txt(2,900 KB) |
説明ファイル | FFQ出力項目と単位(Ver.5版).xlsx |
内容 | 対象 | ファイル名 |
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血漿中親水性代謝産物のターゲットメタボローム解析データ | 160名(2019年冬) | floraindex_blood_2019_winter.txt(359 KB) |
糞便中親水性代謝産物のターゲットメタボローム解析データ | 158名(2019年冬) | floraindex_feces_2019_winter.txt(274 KB) |
糞便中親水性代謝産物のノンターゲットメタボローム解析データ | 158名(2019年冬) | floraindex_feces_nontarget_2019_winter.txt(1,500 KB) |
糞便中胆汁酸のターゲットメタボローム解析データ | 158名(2019年冬) | kazusa_feces_2019_winter.txt(27 KB) |
糞便中脂質のノンターゲットメタボローム解析データ | 158名(2019年冬) | kazusa_feces_nontarget_2019_winter.tsv(382 KB) |
血漿中タンパク質のノンターゲット解析データ | 160名(2019年冬) | olink_blood_2019_winter.tsv(241 KB) |
説明ファイル | - | メタボロームデータの説明.txt |
提供者情報
研究代表者: 西平 順
所 属 機 関: 北海道情報大学 医療情報学部 医療情報学科
URL: https://e-healthsurvey.jp/
プロジェクト/研究グループ名: 「戦略的イノベーション創造プログラム(SIP)[スマートバイオ産業・農業基盤技術]」における「食を通じた健康システムの確立による健康寿命の延伸への貢献」プロジェクト
科研費/助成金(Research Project Number):
科研費・助成金名 | タイトル | 研究課題番号 |
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SIP スマートバイオ産業・農業基盤技術 | 食を通じた健康システムの確立による健康寿命の延伸への貢献 |
関連論文
タイトル | DOI | データID | |
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