AGD Research ID: agd0004.v2
研究内容の概要
目的： チオプリン製剤の副作用に関連する遺伝因子の探索
方法： ゲノムワイド関連解析
対象： 炎症性腸疾患（クローン病、潰瘍性大腸炎、腸管ベーチェット病）患者
| データID | 内容 | 制限 | 公開日 |
|---|---|---|---|
| AGDS_000007 | 炎症性腸疾患1207症例の個人毎のGenotypingデータ | 制限共有 | 2019/09/24 |
| AGDS_000007 データ追加 | 炎症性腸疾患1473症例の個人毎のGenotypingデータ | 制限共有 | 2021/04/19 |
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分子データ
| 対象 |
炎症性腸疾患：1207＋1473症例 クローン病（ICD10：K509）：516＋659症例 潰瘍性大腸炎（ICD10：K519）：674＋785症例 腸管ベーチェット病（ICD10：M352）：16＋27症例 炎症性腸疾患（分類不能）（ICD10：K523）：1＋2症例 |
| 規模 | genome wide SNPs |
| 対象領域（Target Captureの場合） | - |
| Platform | Affymetrix [Japonica Array v1] |
| ソース | 末梢血から抽出したDNA |
| 検体情報（購入の場合） | - |
| 調整試薬（キット名、バージョン） | Axiom 2.0 Reagent Kit |
| Amed Genome group sharing Database Dataset ID | AGDD_000007 |
| 総データ量 | 32＋39 GB（CEL） |
| データ概要 | hum0166 |
| コメント（利用にあたっての制限事項） | AGD policy |
提供者情報
研究代表者： 角田 洋一
所 属 機 関： 東北大学病院・消化器内科
プロジェクト/研究グループ名： MENDEL study group
科研費/助成金（Research Project Number）：
| 科研費・助成金名 | タイトル | 研究課題番号 |
|---|---|---|
| 日本医療研究開発機構（AMED） ゲノム創薬基盤推進研究事業 | チオプリン不耐例を判別するNUDT15 R139C遺伝子多型検査キットの開発を軸とした炎症性腸疾患におけるゲノム医療実用化フレームワークの確立 | 18kk0305002h0003 |
関連論文
| タイトル | DOI | データID | |
|---|---|---|---|
| 1 | NUDT15 codon 139 is the best pharmacogenetic marker for predicting thiopurine-induced severe adverse events in Japanese patients with inflammatory bowel disease: a multicenter study. | doi: 10.1007/s00535-018-1486-7 |
AGDD_000007 |
| 2 | Genetic Analysis of Ulcerative Colitis in Japanese Individuals Using Population-specific SNP Array | doi: 10.1093/ibd/izaa033 | AGDD_000007 |
| 3 | Genetic Background of Mesalamine-induced Fever and Diarrhea in Japanese Patients with Inflammatory Bowel Disease. | doi: 10.1093/ibd/izab004 | AGDD_000007 |
