AGD Research ID: agd0002.v1

研究内容の概要

目的： B型肝炎ワクチンの効果に関連する宿主遺伝因子の同定

方法： ゲノムワイド関連解析

対象： 日本人B型肝炎ワクチン接種者1,193例

URL： http://www.ncgmkohnodai.go.jp/genome/genome_ds/index.html

データID	内容	制限	公開日
AGDS_000001	日本人B型肝炎ワクチン接種者1,193名の個人毎のGenotypingデータ	制限共有	2018/06/08

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分子データ

AGDS_000001（2021年10月1日にJGAへ移行されました：hum0136.v3）


対象	日本人B型肝炎ワクチン接種者（Total：1,193名）　　・ワクチン低反応群（107名、HBsAb 10mIU/mL以下）　　・ワクチン中反応群（351名、HBsAb 10mIU/mL超、100 mIU/mL以下）　　・ワクチン高反応群（735名、HBsAb 100mIU/mL超）
規模	genome wide SNPs
対象領域（Target Captureの場合）	-
Platform	Affymetrix [Axiom Genome-Wide ASI 1 Array]
ソース	末梢血から抽出したDNA
検体情報（購入の場合）	-
調整試薬（キット名、バージョン）	Affymetrix AXIOM 2.0 Reagent Kit
遺伝子型決定アルゴリズム（ソフトウェア）	Genotyping Console ver. 4.2.0.26
マーカー数	約60万SNPs
Amed Genome group sharing Database Data set ID	AGDD_000001
総データ量	31 GB（CEL）
データ概要	hum0136
コメント（利用にあたっての制限事項）	AGD policy

研究代表者： 溝上雅史

所属機関： 国立国際医療研究センター

プロジェクト/研究グループ名： ゲノム医科学プロジェクト

URL： http://www.ncgmkohnodai.go.jp/genome/index.html

科研費/助成金（Research Project Number）：

科研費・助成金名	タイトル	研究課題番号
日本医療研究開発機構（AMED）臨床ゲノム情報統合データベース整備事業	B型肝炎に関する統合的臨床ゲノムデータベースの構築を目指す研究	JP16kk0205007
日本医療研究開発機構（AMED）肝炎等克服緊急対策研究事業	ゲノム網羅的解析によるB型肝炎ウイルス感染の病態関連遺伝子の同定と新規診断法の開発	16fk021010h0001
日本医療研究開発機構（AMED）B型肝炎創薬実用化等研究事業	B型肝炎ウイルス排除、慢性化および肝発がんの機序解明を目指す研究	JP17fk0310115
科学研究費助成事業　基盤研究（C）	B型慢性肝炎とHLA class II遺伝子との関連の包括的理解を目指す研究	16K09387