AGD Research ID: agd0002.v1
研究内容の概要
目的： B型肝炎ワクチンの効果に関連する宿主遺伝因子の同定
方法： ゲノムワイド関連解析
対象： 日本人B型肝炎ワクチン接種者1,193例
URL： http://www.ncgmkohnodai.go.jp/genome/genome_ds/index.html
| データID | 内容 | 制限 | 公開日 |
|---|---|---|---|
| AGDS_000001 | 日本人B型肝炎ワクチン接種者1,193名の個人毎のGenotypingデータ | 制限共有 | 2018/06/08 |
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分子データ
| 対象 |
日本人B型肝炎ワクチン接種者（Total：1,193名） ・ワクチン低反応群（107名、HBsAb 10mIU/mL以下） ・ワクチン中反応群（351名、HBsAb 10mIU/mL超、100 mIU/mL以下） ・ワクチン高反応群（735名、HBsAb 100mIU/mL超） |
| 規模 | genome wide SNPs |
| 対象領域（Target Captureの場合） | - |
| Platform | Affymetrix [Axiom Genome-Wide ASI 1 Array] |
| ソース | 末梢血から抽出したDNA |
| 検体情報（購入の場合） | - |
| 調整試薬（キット名、バージョン） | Affymetrix AXIOM 2.0 Reagent Kit |
| 遺伝子型決定アルゴリズム（ソフトウェア） | Genotyping Console ver. 4.2.0.26 |
| マーカー数 | 約60万SNPs |
| Amed Genome group sharing Database Data set ID | AGDD_000001 |
| 総データ量 | 31 GB（CEL） |
| データ概要 | hum0136 |
| コメント（利用にあたっての制限事項） | AGD policy |
提供者情報
研究代表者： 溝上 雅史
所 属 機 関： 国立国際医療研究センター
プロジェクト/研究グループ名： ゲノム医科学プロジェクト
URL： http://www.ncgmkohnodai.go.jp/genome/index.html
科研費/助成金（Research Project Number）：
| 科研費・助成金名 | タイトル | 研究課題番号 |
|---|---|---|
| 日本医療研究開発機構（AMED）臨床ゲノム情報統合データベース整備事業 | B型肝炎に関する統合的臨床ゲノムデータベースの構築を目指す研究 | JP16kk0205007 |
| 日本医療研究開発機構（AMED）肝炎等克服緊急対策研究事業 | ゲノム網羅的解析によるB型肝炎ウイルス感染の病態関連遺伝子の同定と新規診断法の開発 | 16fk021010h0001 |
| 日本医療研究開発機構（AMED）B型肝炎創薬実用化等研究事業 | B型肝炎ウイルス排除、慢性化および肝発がんの機序解明を目指す研究 | JP17fk0310115 |
| 科学研究費助成事業 基盤研究（C） | B型慢性肝炎とHLA class II遺伝子との関連の包括的理解を目指す研究 | 16K09387 |
関連論文
| タイトル | DOI | データID | |
|---|---|---|---|
| 1 | Key HLA‐DRB1‐DQB1 haplotypes and role of the BTNL2 gene for response to a hepatitis B vaccine | doi: 10.1002/hep.29876 |
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