Amed Genome group sharing Database(AGD)は国立研究開発法人日本医療研究開発機構(AMED)ゲノム制限共有データの共有を目的としたデータベースです。

 

データ利用方法はこちらをご覧下さい。

Research ID研究題目公開日データの種類研究方法手法

参加者

(対象集団)

提供者

セキュリティ

レベル

agd0008.v2

AGDS_000005

バイオバンク・ジャパンの運営・管理と個別化医療の実現に向けた疾患バイオマーカー探索

v1:2019/07/23

v2:2022/02/01

NGS

(WGS)

配列決定

Illumina

(HiSeq 2500)

バイオバンク・ジャパン登録患者:255名

(日本人)

松田 浩一

制限(Type I)

agd0009.v1

AGDS_000008

がん患者の臨床検体を用いた、治療効果および毒性に関する遺伝子のプロファイリング研究

v1:2020/10/12

NGS

(Target Capture)

配列決定

Illumina

(MiSeq、NextSeq)

癌患者:507名

(日本人)

河野 隆志

制限(Type I)

agd0015.v1

AGDS_000012

次世代シークエンサーを用いた心不全の発症機序の解明

v1:2022/12/20

NGS

(RNA-seq、snRNA-seq、snATAC-seq)

発現

クロマチン構造

Illumina

(NovaSeq 6000)

心房細動:333症例

(日本人)

小室 一成

制限(Type I)

agd0016.v1

AGDS_000013

オーダーメイド医療開発プロジェクト:全ゲノム解析と組織オミックス解析による心房細動の病態解明と精密医療

v1:2023/01/18

NGS

(WGS)

配列決定

Illumina

(NovaSeq 6000)

心房細動:547症例

(日本人)

伊藤 薫

制限(Type I)

agd0020.v2

AGDS_000011

OMICS解析による呼吸器疾患の病態メカニズムの解明

v1:2023/07/27

v2:2023/10/26

NGS

(WGS、Exome、RNA-seq、Visium Spatial Gene Expression)

メタゲノム

GeoMx Digital Spatial Profiler

配列決定

発現

メタゲノム

病理画像

プロテオーム

Illumina

(NovaSeq 6000)

10x Genomics

(Visium)

Nanostring

(GeoMx)

慢性閉塞性肺疾患:50+50症例

(日本人)

遠西 大輔

制限(Type I)

agd0021.v1

AGDS_000014

心房筋生検による心房細動基質の組織学的評価

v1:2023/01/18

NGS

(WGS)

配列決定

Illumina

(NovaSeq 6000)

心房細動:315症例

(日本人)

山口 尊則

制限(Type I)

agd0023.v1

AGDS_000015

がんや難病に関するゲノム医療の推進に必要な健常群・疾患コントロール群データの構築

v1:2023/06/22

NGS

(WGS)

配列決定

Illumina

(NovaSeq 6000)

健常者(難病やがんを罹患していない生活習慣病を持つ人を含む):9830名

(日本人)

徳永 勝士

制限(Type II)

agd0029.v1

AGDS_000016

疾患の解明・克服を目指した糖尿病・内分泌・代謝疾患のバイオリソースバンク構築(MISSION-DM-ENDO)

v1:2023/09/08

NGS

(WGS、miRNA-seq)

メタゲノム

メタボローム

配列決定

発現

メタゲノム

メタボローム

Illumina

(NovaSeq 6000、MiSeq)

Agilent Technologies

(Agilent CE system、Agilent LC System)

糖尿病:200症例

(日本人)

梶尾 裕

制限(Type I)

 

※合理的な一定期間経過後にNBDCヒトデータベース等の公開系データベースからの公開が見込まれるデータを格納するデータベースです。