Amed Genome group sharing Database（AGD）は国立研究開発法人日本医療研究開発機構（AMED）ゲノム制限共有データの共有を目的としたデータベースです。
データ利用方法はこちらをご覧下さい。
| Research ID | 研究題目 | 公開日 | データの種類 | 研究方法 | 手法 |
参加者 （対象集団） | 提供者 |
セキュリティ レベル |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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AGDS_000002 |
難聴の遺伝子解析と臨床応用に関する研究 |
v1:2018/07/02 v2:2021/07/30 |
NGS （Target Capture） |
63 / 69遺伝子領域 配列決定 |
Life technoligies （Ion PGM/IonProton） |
非症候群性難聴：2968症例 （日本人） |
宇佐美 真一 |
制限（Type I） |
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AGDS_000001 |
B型肝炎に関する統合的臨床ゲノムデータベースの構築を目指す研究 |
v1:2018/06/08 |
SNP-chip |
ゲノムワイド関連解析 |
Affymetrix （Axiom ASI） |
B型肝炎ワクチン接種者：1,193名 （日本人） |
溝上 雅史 |
制限（Type I） |
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AGDS_000003 |
リンチ症候群の拾い上げ及び遺伝子診断に関する多施設共同研究 |
v1:2020/03/23 v2:2020/04/13 |
NGS （Target Capture） |
配列決定 |
Illumina （MiSeq） |
リンチ症候群疑い症例：100+82症例 患者の血縁者：15+23名 （日本人） |
赤木 究 |
制限（Type I） |
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AGDS_000007 |
炎症性腸疾患患者におけるチオプリン関連副作用とNUDT15遺伝子多型との相関性に関する多施設共同研究(MENDEL Study) |
v1:2019/09/24 v2:2021/04/19 |
SNP-chip |
ゲノムワイド関連解析 |
Affymetrix （Japonica Array v1） |
炎症性腸疾患：1207＋1473症例 （日本人） |
角田 洋一 |
制限（Type I） |
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AGDS_000004 |
精神神経疾患の原因解明および診断法・治療法の開発に関する研究 |
v1:2019/04/18 |
NGS （Exome） |
配列決定 |
Illumina （HiSeq 2000/2500） |
双極性障害発症者およびその両親（トリオ）：66家系（198名） （日本人） |
加藤 忠史 |
制限（Type I） |
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AGDS_000009 |
臨床ゲノム情報統合データベース整備事業（希少・難病分野） |
v1:2021/07/30 |
NGS （WGS） |
配列決定 |
Illumina （HiSeq 2500） |
バイオバンク・ジャパン登録患者：1007名 （日本人） |
桃沢 幸秀 |
制限（Type I） |
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AGDS_000005 |
バイオバンク・ジャパンの運営・管理と個別化医療の実現に向けた疾患バイオマーカー探索 |
v1:2019/07/23 v2:2022/02/01 |
NGS （WGS） |
配列決定 |
Illumina （HiSeq 2500/X Five） |
バイオバンク・ジャパン登録患者：2219名 （日本人） |
松田 浩一 |
制限（Type I） |
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AGDS_000008 |
がん患者の臨床検体を用いた、治療効果および毒性に関する遺伝子のプロファイリング研究 |
v1:2020/10/12 |
NGS （Target Capture） |
配列決定 |
Illumina （MiSeq、NextSeq） |
癌患者：507名 （日本人） |
河野 隆志 |
制限（Type I） |
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AGDS_000006 |
悪性腫瘍のゲノム・エピゲノム解析による病態解明 |
v1:2019/07/09 |
NGS （WGS） |
配列決定 |
10x Genomics （Chromium Controller） |
肺癌：7症例 大腸癌：12症例 乳癌：11症例 （日本人） |
間野 博行 |
制限（Type I） |
※合理的な一定期間経過後にNBDCヒトデータベース等の公開系データベースからの公開が見込まれるデータを格納するデータベースです。
